Antikorlar, bağışıklık sisteminin temel bir parçasıdır ve biyolojik araştırmalarda yaygın olarak kullanılır. Birçok laboratuvar tekniğinin vazgeçilmezidir. Bazı araştırmacılar kendi antikorlarını üretirken, birçok önemli protein için ticari olarak temin edilebilir antikorlar bulunmaktadır.
Ancak Mayıs ayında Northwestern Üniversitesi’nde doktora öğrencisi olan Reese Richardson, bu antikorların performansını gösteren laboratuvar deneylerinde kullanılan bazı görsellerin manipüle edildiğini keşfetti. Bu manipülasyonlar, akademik yayınlarda yer alması durumunda makalenin geri çekilmesine neden olabilecek değişiklikleri içeriyordu. Richardson daha kapsamlı bir araştırma yaparak, 17.000’den fazla ticari antikorun pazarlanmasında kullanılan görsellerde sorunlu manipülasyonlara rastladı.
Antikorlar, bağışıklık sisteminin belirli proteinleri tanımak için ürettiği moleküllerdir. Bu proteinler genellikle patojenlerin yüzeyinde bulunur, ancak bağışıklık sistemi bir proteinin nereden geldiğini bilmez. Bu nedenle, bir hayvanın ilgilenilen proteini ile enjekte edildiğinde, o proteine karşı antikorlar üretilir.
Bu tanıma son derece faydalı olabilir. Örneğin, kültürlenmiş hücreleri uygun şekilde hazırlayarak, bu antikorları kullanarak proteinin hücredeki konumunu belirleyebilirsiniz. Benzer şekilde, bir organ veya embriyodaki hangi dokuların proteini ürettiğini de öğrenebilirsiniz. Son olarak, bir hücreden tüm proteinleri toplayıp, bunları bir jel üzerinde ayırarak, proteinin nereye yerleştiğini görebilir ve böylece proteinin üretilip üretilmediği veya kimyasal modifikasyonlara uğrayıp uğramadığı gibi bilgileri elde edebilirsiniz.
Antikorları satan şirketler de bu aynı deneyleri kullanarak antikorlarının işe yaradığını göstermeye çalışır ve genellikle bu deneylerden elde edilen görüntüleri bir pazarlama aracı olarak kullanır. Bir araştırmacının bu antikor ile bir western blot yapmak istediğinde, bu tür görüntüler antikorun iyi sonuçlar vereceğinin bir işareti olarak kabul edilir.
Ancak Richardson’ın bulguları, bu görüntülerin bazen antikorun gerçek etkinliği hakkında yanıltıcı bir tablo çizdiğini gösteriyor. Bu nedenle, Sholto David ile birlikte çalışarak, ticari antikor verilerindeki yanıltıcı manipülasyonları vurgulayabilecek otomatik testler geliştirdi. Çok sayıda sorunlu görüntü buldu: Yaklaşık 17.500 antikor, bu antikorların geldiği 16 farklı şirketten. İnceledikleri ilk 25 görüntüden yaklaşık %7’sinde manipülasyon belirtileri tespit edildi. İlk olarak bulunan bazı örnekleri burada paylaşıyoruz.
Bu keşfin sonuçları oldukça önemli. Bir araştırmacı, antikorun temiz ve net veriler üreteceğine inanarak satın alır ve bunun yerine iyi sonuçlar elde edemezse, genellikle sorunun kendisinde olduğunu düşünür. Bu durum, araştırmacının prosedürü gidermek için zaman harcamasına ve kullanışlı veriler elde etmek için biraz farklı koşullar denemesine yol açabilir. Ancak antikor bu tür sonuçları vermiyorsa, tüm bu çabalar boşa gidecektir.
Nature dergisinin yeni bulgular hakkındaki haberinde yer alan ifadeler, bu antikorları satan şirketlerden bazılarının tepkilerini içeriyor. Bu tepkiler, “durumu inceleyeceğiz”den “bu bir sorun değil”e kadar değişmektedir. Antikor tabanlı bir deneyde başarısızlıkla karşılaşan araştırmacılar için bu durum hayal kırıklığı yaratabilir.
Kaynak: Ars Technica
Bu Gelişmeyi Toplulukta Değerlendirin
Haber hakkındaki düşüncelerinizi, donanım deneyimlerinizi ve teknik sorularınızı topluluk üyeleriyle anlık olarak tartışın.
Bu gelişme hakkında düşüncelerinizi, donanım deneyimlerinizi veya sorularınızı Topluluk Forumumuzda paylaşın.
Foruma Katıl & Yanıtla ➔
Söz sizde.
Deneyiminizi, sorularınızı ve katkılarınızı paylaşın. E-posta adresiniz yayımlanmaz.